Emilie Nautnes dołączyła do CFF Madrid po zakończeniu swojej kariery w norweskim Rosenborgu. Szczegóły kontraktu nie zostały podane do informacji publicznej.
25-letnia napastniczka rozpoczęła swoją przygodę z piłką nożną w Fortunie Ålesund, a później grała w Arna-Bjørnar i LSK Kvinner, z którym zdobyła mistrzostwo oraz Puchar Norwegii w 2019 roku.
Nautnes regularnie otrzymuje powołania do reprezentacji Norwegii. Zadebiutowała w kadrze narodowej w 2018 roku, a rok później uczestniczyła w Mistrzostwach Świata we Francji.